国家食品药品监督管理局职责有两个大的变化，一是将综合协调食品安全、组织查处食品安全重大事故的职责划给卫生部；二是将卫生部食品卫生许可，餐饮业、食堂等消费环节食品安全监管和保健食品、化妆品卫生监督管理的职责，划入国家食品药品监督管理局。
国家局职能调整之后的工作范围包括：
（一）制定药品、医疗器械、化妆品和消费环节食品安全监督管理的政策、规划并监督实施，参与起草相关法律法规和部门规章制度。
（二）负责消费环节食品卫生许可和食品安全监督管理。
（三）制定消费环节食品安全管理规范并监督实施，开展消费环节食品安全状况调查和监测工作，发布与消费环节食品安全监管有关的信息。
（四）负责化妆品卫生许可、卫生监督管理和有关化妆品的审批工作。
（五）负责药品、医疗器械行政监督和技术监督，负责制定药品和医疗器械研制、生产、流通、使用方面的质量管理规范并监督实施。
（六）负责药品、医疗器械注册和监督管理，拟订国家药品、医疗器械标准并监督实施，组织开展药品不良反应和医疗器械不良事件监测，负责药品、医疗器械再评价和淘汰，参与制定国家基本药物目录，配合有关部门实施国家基本药物制度，组织实施处方药和非处方药分类管理制度。
（七）负责制定中药、民族药监督管理规范并组织实施，拟订中药、民族药质量标准，组织制定中药材生产质量管理规范、中药饮片炮制规范并监督实施，组织实施中药品种保护制度。
（八）监督管理药品、医疗器械质量安全，监督管理放射性药品、麻醉药品、毒性药品及精神药品，发布药品、医疗器械质量安全信息。
（九）组织查处消费环节食品安全和药品、医疗器械、化妆品等的研制、生产、流通、使用方面的违法行为。
（十）指导地方食品药品有关方面的监督管理、应急、稽查和信息化建设工作。
（十一）拟订并完善执业药师资格准入制度，指导监督执业药师注册工作。
（十二）开展与食品药品监督管理有关的国际交流与合作。
（十三）承办国务院及卫生部交办的其他事项。
根据上述职责，国家食品药品监督管理局设10个内设机构：办公室（规划财务司）、政策法规司、食品许可司、食品安全监管司、药品注册司（中药民族药监管司）、医疗器械监管司、药品安全监管司、稽查局、人事司、国际合作司（港澳台办公室）。国家食品药品监督管理局机关行政编制为197名。
机构改革后，食品药品监管职能的调整将有利于进一步落实食品安全综合监督责任，进一步理顺医疗管理和药品管理的关系，体现精简统一效能的改革原则和决策权、执行权、监督权既相互制约又相互协调的要求，强化食品药品安全监管，这也与深化医药卫生体制改革的总体思路相吻合，必将对卫生改革与发展起到推动作用，更好地保障人民群众身体健康和生命安全。
9月1日，国家食品药品监督管理局局务会审议并原则同意了国家食品药品监督管理局机关司局的详细职责以及各司局相关处室的职责，即国家食品药品监督管理局机关“三定”规定，近日将公布。这标志着国家食品药品监督管理局贯彻落实《国务院机构改革方案》完成了阶段性任务，进入到具体的组织实施阶段。
下一步，国家食品药品监督管理局将按照国务院机构改革方案和卫生部的要求，积极稳妥地实施机构改革方案，转变职能，提高效能，为整体推进医药卫生体制改革，确保群众饮食用药安全，提高群众健康水平打好基础，不断建立履行新职能的工作机制，同时积极调整工作关系，完善工作制度，修改完善机关工作规则，确保新职能的顺利运行。
国家食品药品监督管理局将按照新职能的要求，以更加奋发有为的精神状态进一步落实科学发展观，进一步实践我们一再倡导的科学监管理念，加大监管力度，加强队伍自身的建设，履行好国务院赋予我们的职能和责任，把我们的食品药品监管工作做得更好。
